CP2K的功能很多,其輸入文件的結(jié)構(gòu)也比Gaussian或者VASP等常見的計算化學(xué)軟件更加復(fù)雜。這里,我直接給出各種CP2K輸入文件作為例子,并說明其輸入文件中各種參數(shù)的設(shè)置。
3.1 CP2K的各種運(yùn)行方式(RUN_TYPE)
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BAND使用band方法來進(jìn)行最低能量路徑(MEP)以及反應(yīng)過渡態(tài)的搜索,通常可以使用的方法有CI-NEB, IT-NEB等方法。
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CELL_OPT晶胞參數(shù)的優(yōu)化。
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ENERGY計算當(dāng)前結(jié)構(gòu)的能量。對于DFT來說,就是一個SCF計算。
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ENERGY_FORCE計算當(dāng)前結(jié)構(gòu)的能量,同時計算出每個原子上的梯度(即受力)。
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GEO_OPT對當(dāng)前結(jié)構(gòu)進(jìn)行幾何結(jié)構(gòu)的優(yōu)化,以獲得當(dāng)前結(jié)構(gòu)對應(yīng)的局部極小點(diǎn)或者過渡態(tài)。GEO_OPT有兩種類型,一種是MINIMIZATION,即優(yōu)化到極小點(diǎn);一種是TRANSITION_STATE,即優(yōu)化到過渡態(tài)。過渡態(tài)的優(yōu)化采用Dimer方法來實(shí)現(xiàn)。
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MD分子動力學(xué)模擬?;诘谝辉淼姆肿觿恿W(xué)模擬是CP2K的一大優(yōu)勢。此外,CP2K也支持使用力場以及DFTB等方法進(jìn)行分子動力學(xué)模擬。
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VIBRATIONAL_ANALYSIS對當(dāng)前結(jié)構(gòu)進(jìn)行振動分析,也就是頻率計算。頻率計算可以計算部分原子的頻率(INVOLVED_ATOMS),也可以計算某一頻率范圍內(nèi)的頻率計算(MODE_SELECTIVE)。
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我們邀請了從頭算分子動力學(xué)領(lǐng)域世界頂尖學(xué)者Hutter教授團(tuán)隊蘭晶崗博士進(jìn)行“計算化學(xué)模擬,讓你的實(shí)驗(yàn)更“有數(shù)”!”的培訓(xùn),本培訓(xùn)基于知名免費(fèi)開源計算軟件CP2K,此軟件由Hutter團(tuán)隊開發(fā)并運(yùn)維,功能與VASP比肩。
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本課程重點(diǎn)側(cè)重應(yīng)用,弱化過于抽象的公式和理論。通過簡單介紹理論并且結(jié)合計算輸入文件,幫助學(xué)員快速上手使用CP2K軟件來完成自己計算要求。
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