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CP2K入門教程-8:振動頻率分析

用CP2K程序進行振動頻率分析,首先需要設置RUN_TYPE為VIBRATIONAL_ANALYSIS。輸入文件例子如下:

&GLOBAL

PROJECT cp2k

RUN_TYPE VIBRATIONAL_ANALYSIS

PRINT_LEVEL medium

&END GLOBAL

然后,設置頻率分析部分輸入文件

&VIBRATIONAL_ANALYSIS

DX 0.01

INTENSITIES F

NPROC_REP 128

FULLY_PERIODIC T

&END VIBRATIONAL_ANALYSIS

CP2K計算頻率使用的是數值算法,即對每個原子向+x, -x, +y, -y, +z, -z 6個方向分別進行移動,用數值的方法得到能量的二階導(即力常數),然后計算頻率。所以,如果有N個原子要進行移動,總共要進行6N+1次SCF收斂計算。

關鍵詞

設置示例

解釋

DX

0.01

每次移動原子時的步長

INTENSITIES

F

是否計算紅外強度。如果設置為T,需要在DFT部分進行偶極矩的計算(關鍵詞MOMENTS)。

NPROC_REP

128

并行計算頻率時,每個REPLICA使用的CPU數目

FULLY_PERIODIC

T

避免從Hessian矩陣中消除轉動模式。開啟該關鍵詞后,對于N個原子的體系會計算出3N-3個頻率,其中包含了3個轉動自由度。

要計算部分原子的振動頻率,有兩種辦法。一種是直接在MOTION中使用CONSTRAINT對不需要進行頻率分析的原子進行固定。一種是使用MODE_SELECTIVE模式。例子如下:

&VIBRATIONAL_ANALYSIS

NPROC_REP 16

DX 0.01

INTENSITIES T

&MODE_SELECTIVE

ATOMS 82 83

INITIAL_GUESS ATOMIC

EPS_NORM 1.0E-5

EPS_MAX_VAL 1.0E-6

&INVOLVED_ATOMS

INVOLVED_ATOMS 82 83

&END INVOLVED_ATOMS

&END &MODE_SELECTIVE

&END VIBRATIONAL_ANALYSIS

上面的例子中,對82?和83兩個原子進行了振動頻率分子。需要注意的是,使用這種方法計算頻率,使用的REPLICA數目不能太少。REPLICA的數目是這樣計算的:NREP=總CPU數目/NPROC_REP。上述輸入文件,如果使用的總CPU數目為64,則共有NREP=4,即共有4個REPLICA。如果只使用一個REPLICA,使用MODE_SELECTIVE算法計算頻率時,就會只跟蹤一個頻率,無法得到正確的結果。

另外,使用CP2K程序計算一個優化好的結構式的頻率時,也常會出現多個虛頻。這并非是幾何優化出現了問題,而是CP2K計算使用GTH贗勢時存在的一個問題。詳細內容請參考:

https://groups.google.com/forum/?fromgroups#!topic/cp2k/DVCV0epl7Wo

?

解決方案有四種:

  1. 使用NLCC贗勢。http://arxiv.org/abs/1212.6011?不過,NLCC贗勢很不完整,只有B-Cl的元素有,且只提供了PBE泛函的贗勢。

  2. 增大CUTOFF,使用600 Ry以上的CUTOFF。

  3. 在XC_GRID部分使用平滑參數SMOOTING。不推薦使用。

  4. 在XC_GRID部分使用USE_FINER_GRID。加上這個參數后,XC部分的格點的精度提高為4*CUTOFF

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