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Nature Catalysis重磅綜述:數(shù)據(jù)科學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí),催化研究的未來利劍!

Nature Catalysis重磅綜述:數(shù)據(jù)科學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí),催化研究的未來利劍!
第一作者:Manu Suvarna
通訊作者:Javier Pérez-Ramírez
通訊單位:蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)
論文速覽
本文綜述了數(shù)據(jù)科學(xué)在催化研究中的應(yīng)用,強(qiáng)調(diào)了催化劑發(fā)現(xiàn)和開發(fā)對(duì)全球能源、可持續(xù)性和醫(yī)療保健需求的重要性。過去十年中,數(shù)據(jù)科學(xué)概念在催化研究中的利用顯著增加,以幫助解決這些問題。
文章全面回顧了催化研究者如何利用數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)策略解決多相、均相和酶催化中的復(fù)雜挑戰(zhàn)。研究者將所有研究分為演繹型或歸納型模式,并統(tǒng)計(jì)推斷催化任務(wù)、模型反應(yīng)、數(shù)據(jù)表示和算法選擇的普遍性。
文章突出了該領(lǐng)域的前沿和催化子學(xué)科之間的知識(shí)遷移可能性。關(guān)鍵評(píng)估揭示了實(shí)驗(yàn)催化中數(shù)據(jù)科學(xué)探索的明顯差距,并通過詳細(xì)闡述數(shù)據(jù)科學(xué)的四個(gè)支柱(即描述性、預(yù)測(cè)性、因果性和規(guī)范性分析)彌合這一差距。
文章提倡將這些分析方法納入常規(guī)實(shí)驗(yàn)工作流程,并強(qiáng)調(diào)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化對(duì)未來數(shù)字催化研究的重要性。
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圖文導(dǎo)讀
Nature Catalysis重磅綜述:數(shù)據(jù)科學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí),催化研究的未來利劍!
圖1:展示了過去十年數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)催化研究的增長(zhǎng)趨勢(shì),特別是從2018年開始的指數(shù)增長(zhǎng)。圖中將催化問題解決使用機(jī)器學(xué)習(xí)(ML)的方法分類為演繹型和歸納型兩種通用模式,其中演繹型任務(wù)旨在篩選或優(yōu)化催化性能,而歸納型任務(wù)則側(cè)重于通過描述符或活性位點(diǎn)識(shí)別來得出機(jī)理見解。
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圖2:網(wǎng)絡(luò)圖映射了基于催化類型(a)和驅(qū)動(dòng)力(b)的演繹任務(wù)之間的關(guān)系。圖中的節(jié)點(diǎn)表示顯著實(shí)體的出版物計(jì)數(shù),包括催化類型、驅(qū)動(dòng)力、任務(wù)和數(shù)據(jù)源,節(jié)點(diǎn)之間的弧長(zhǎng)與出版物之間的相互關(guān)系頻率成正比。
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圖3:總結(jié)了催化領(lǐng)域主要的開源數(shù)據(jù)庫,根據(jù)催化類型、數(shù)據(jù)源和它們所引發(fā)任務(wù)進(jìn)行分類,并展示了這些數(shù)據(jù)庫對(duì)FAIR(可發(fā)現(xiàn)、可訪問、可互操作和可重用)原則的遵循程度。
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圖4:通過ML建立結(jié)構(gòu)-屬性-性能關(guān)系的圖譜,展示了多相(a)、均相(b)和酶催化(c)中用于建立結(jié)構(gòu)-屬性關(guān)系的ML算法的使用情況。
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圖5:展示了催化中先進(jìn)的AI框架,包括從文獻(xiàn)中提取合成程序和催化屬性的語言模型(a),主動(dòng)學(xué)習(xí)用于探索特定催化劑的化學(xué)空間(b),使用GANs和VAEs等深度學(xué)習(xí)模型進(jìn)行假想合金和配體的虛擬生成(c),以及深度強(qiáng)化學(xué)習(xí)用于優(yōu)化催化表面或反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)(d)。
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圖6:數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)催化的四個(gè)支柱示意圖,包括描述性分析、預(yù)測(cè)性分析、因果性分析和規(guī)范性分析。
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圖7:展示了數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)催化的生命周期,包括描述性、預(yù)測(cè)性、因果性和規(guī)范性分析在實(shí)驗(yàn)催化工作流程中的應(yīng)用。
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圖8:展示了將ML算法與表征工具集成的最新進(jìn)展,包括深度學(xué)習(xí)在透射電子顯微鏡圖像分析中用于自動(dòng)化原子檢測(cè)(a),以及結(jié)合XANES光譜學(xué)和ML方法用于改進(jìn)多相催化劑的3D幾何結(jié)構(gòu)(b)。
總結(jié)展望
文章強(qiáng)調(diào)了數(shù)據(jù)科學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí)(ML)在催化研究中的前景,預(yù)示著這些技術(shù)將極大提高研究生產(chǎn)力。同時(shí)指出,盡管這些技術(shù)不會(huì)取代人類的直覺和專業(yè)知識(shí),但它們應(yīng)該被催化研究者們接受,并成為每個(gè)從業(yè)者工具箱的一部分。
文章呼吁催化從業(yè)者發(fā)展對(duì)數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)概念和建模策略的基礎(chǔ)理解,并熟悉數(shù)據(jù)準(zhǔn)備、算法適用性評(píng)估及其優(yōu)勢(shì)和局限性。同時(shí),也鼓勵(lì)數(shù)據(jù)科學(xué)家培養(yǎng)對(duì)催化的欣賞,有效地將催化過程的復(fù)雜性轉(zhuǎn)化為數(shù)據(jù)科學(xué)問題,并理解實(shí)驗(yàn)限制。
文章展望了一個(gè)未來,其中數(shù)字工具無縫集成到催化研究中,加速實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)分析和新知識(shí)的創(chuàng)造,促進(jìn)數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的決策制定,助力解決催化研究中的一些重大挑戰(zhàn)。
文獻(xiàn)信息
標(biāo)題:Embracing data science in catalysis research
期刊:Nature Catalysis
DOI:10.1038/s41929-024-01150-3
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